Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DSG1Q02413 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms