Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XPCQ01831 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XPCQ01831 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XPCQ01831 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms