Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms