Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms