Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms