Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms