Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms