Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLTPP55058 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLTPP55058 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLTPP55058 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLTPP55058 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLTPP55058 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLTPP55058 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLTPP55058 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms