Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.02
ATP1B3P54709 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1B3P54709 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms