Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CRIP1P50238 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CRIP1P50238 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms