Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms