Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms