Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITPNBP48739 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms