Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms