Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRATP43155 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRATP43155 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRATP43155 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRATP43155 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms