Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP6V1E1P36543 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms