Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPC1P35052 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPC1P35052 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms