Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms