Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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