Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HRCP23327 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HRCP23327 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HRCP23327 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HRCP23327 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HRCP23327 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HRCP23327 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms