Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSPP15924 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSPP15924 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSPP15924 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSPP15924 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSPP15924 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DSPP15924 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DSPP15924 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSPP15924 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms