Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GP1BBP13224 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms