Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3P10147 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3P10147 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3P10147 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3P10147 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3P10147 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3P10147 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3P10147 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3P10147 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3P10147 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3P10147 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms