Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CT47B1P0C2W7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms