Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP10P09238 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP10P09238 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP10P09238 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP10P09238 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP10P09238 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP10P09238 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP10P09238 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms