Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFMP07197 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFMP07197 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFMP07197 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFMP07197 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms