Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYBBP04839 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CYBBP04839 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CYBBP04839 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYBBP04839 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms