Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TYMSP04818 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms