Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLDN9O95484 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLDN9O95484 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms