Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
E2F6O75461 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E2F6O75461 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F6O75461 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F6O75461 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F6O75461 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms