Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NPHP4O75161 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NPHP4O75161 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms