Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPLO60437 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPLO60437 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPLO60437 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPLO60437 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPLO60437 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms