Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB3O43889 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB3O43889 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms