Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F3O00716 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms