Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HHLA1C9JL84 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms