Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPDC1A2A3K4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms