Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00312Q9Y6C7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms