Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AUP1Q9Y679 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms