Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms