Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4BQ9Y4P1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms