Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms