Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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