Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THRAP3Q9Y2W1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms