Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPS3Q9UNS2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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