Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRTO4Q9UKD2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRTO4Q9UKD2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms