Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC24A2Q9UI40 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260 ms