Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms