Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RPS6KB2Q9UBS0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms