Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms