Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NLKQ9UBE8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLKQ9UBE8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms